بخش های بالینی (بستری)
- مراقبت ویژه کودکان (ICU, PICU)
- فوق تخصصی هماتولوژی و انکولوژی کودکان 1 و 2 ( خون و سرطان کودکان)
- شیمی درمانی سرپایی
- فوق تخصصی نفرولوژی کودکان (کلیه کودکان)
- همودیالیز
- دیالیز صفاقی
- اتاق عمل کودکان
- فوق تخصصی جراحی کودکان
- جنرال و اورژانس کودکان
- درمانگاه هموفیلی و تالاسمی (درمانگاه سرور)
- درمانگاه تخصصی و فوق تخصصی کودکان
بخش های پارکیلنیک
- یورودینامیک (نوار مثانه)
- آسیب شناسی
- آزمایشگاه
- دندانپزشکی
- رادیولوژی و سونوگرافی
- VCUG
- الکتروآنسفالوگرافی (نوارمغز)
- اکوکاردیوگرافی (نوار قلب)
- گفتار درمانی
- داروخانه